El CA en Gestión Pública y Desarrollo Social, GEPDES, cultiva las siguientes tres Líneas Generales de Aplicación del Conocimiento:

a) Enfoques para el estudio de problemas de gestión, organización y gobernabilidad institucional. Se orienta a realizar una revisión sistemática de los aportes teóricos y las aproximaciones metodológicas de diversas disciplinas sociales para explicar los problemas de gestión, organización y gobernabilidad institucional. Además, reconoce la necesidad de realizar esfuerzos de formulación teórica que analicen la especificidad de las realidades de los países de América Latina y particularmente de México. Por ello, considera indispensable un abordaje de la conformación histórico-institucional de regiones, países, sectores y organismos, evitando así el traslado mecánico de propuestas teóricas formuladas para explicar realidades con otro origen y condiciones de desarrollo. Por otra parte, esta línea atiende la consideración de aproximaciones metodológicas novedosas que permitan el diseño de los instrumentos y herramientas requeridos para llevar a cabo análisis empíricos y estudios comparativos. La confección de modelos de interpretación y el análisis de escenarios cobran especial relevancia.

b) Procesos de institucionalización y cambio en las instituciones de educación superior. Se propone analizar los factores del contexto político-cultural mexicano que explican la conformación y el funcionamiento de las estructuras, prácticas, reglas y rutinas bajo las cuales operan las instituciones de educación superior. Asimismo, persigue identificar los procesos de legitimación de sus modos de operación y desempeño. Finalmente, se plantea el examen de las estrategias de las organizaciones considerando su medio ambiente institucional, lo que permitirá reconocer las “reglas del juego” que establecen los actores para regular sus interacciones. Así, su eje de preocupación central se ubica en el análisis de los procesos de institucionalización y cambio considerando tanto las reglas formales como los patrones de comportamiento informal. Cobran especial relevancia los procesos de modernización experimentados en México a partir de los años ochenta, así como el análisis de espacios organizacionales en los que se aprecia la resistencia al cambio provocando una debilidad institucional que dificulta el desarrollo, lo que se traduce en graves problemas de eficacia y legitimidad. Para el desarrollo de esta línea, la reconstrucción histórica, considerando el análisis de casos y los estudios comparativos se considera como una orientación metodológica significativa.

 
c) Regulación, acción pública y gestión social. Persigue analizar las transformaciones que ha experimentado el Estado mexicano a partir de la aplicación de un modo de regulación basado principalmente en el mercado y sus efectos en las formas y modalidades adoptadas en el diseño e implementación de las políticas públicas y la gestión social. En este contexto resulta necesario clarificar la pertinencia de la aplicación de conocimientos y herramientas administrativas y de dirección provenientes de la empresa en el manejo de los asuntos públicos. Implica además la consideración de las estrategias para reformar al Estado tomando en cuenta el reordenamiento del aparato público que se deriva de las políticas de privatización, desregulación y apretura comercial. Asimismo, supone el examen de la creación y evolución de los organismos reguladores de mercado considerando las ventajas y limitaciones del marco institucional y jurídico disponible para impulsar el desarrollo económico y social. Esta línea considera también la participación social para el desarrollo de las políticas públicas, como en un modelo de abajo hacia arriba, en donde la iniciativa local ejerce influencia para moldear las acciones gubernamentales. En este sentido, cobra gran relevancia el análisis de los efectos de la participación en la creación de capital social que se traducen en relaciones de confianza y reciprocidad en las comunidades locales y las organizaciones, fortaleciendo la gobernabilidad institucional al operar con mayor eficacia y legitimidad. Una de las herramientas metodológicas más pertinentes en esta línea de generación de conocimiento es la realización de estudios de caso que permitan interpretar las dinámicas organizacionales y locales.